En MHS se imparten cursos avanzados para aquellos alumnos cuyo nivel académico o intereses les permitan afrontar retos adicionales. En el catálogo de cursos «Skipper Log», busca estas denominaciones:

• Cursos avanzados (Inglés, Matemáticas, Ciencias, Ciencias Sociales, Idiomas extranjeros e inmersión en idiomas extranjeros)
• Cursos de nivel avanzado (AP)
• Programa del Bachillerato Internacional (IB) o asignaturas individuales del IB
• Project Lead the Way (PLTW)
• Minnetonka Research es una auténtica oportunidad de investigación para los estudiantes que hayan completado los cuatro requisitos básicos de ciencias y un curso de ciencias de AP o IB (proceso de solicitud).
• Tonka Online ofrece varios cursos de nivel avanzado
• VANTAGE combina cursos AP o IB con un plan de estudios práctico y basado en proyectos.